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疫苗是可針對特定傳染病提供主動獲得性免疫的生物制品，它可以是預防性的，如預防或緩解未來感染天然或“野生”病原體的影響，也可以是治療性的，如正在研發的癌癥疫苗。疫苗分為滅活疫苗、減毒活疫苗、重組蛋白疫苗、病毒載體疫苗等，在不同疫苗的工業化生產中，細胞工廠是常用的大規模細胞培養裝置。

疫苗的工業化生產極具挑戰性，在其過程中，涉及到細胞的擴增，鑒于生產工藝的復雜性，如何安全、穩定地放大成為業內關注的焦點。細胞培養放大的原則是大規模培養與小規模培養保持相對穩定的環境，在相同的環境下才會使得細胞生長密度、活率及產物的表達等保持穩定。

細胞工廠是一種設計精巧的細胞培養裝置，占用空間小、降低污染、提高產量、可控性好，被越來越多的生物制藥生產企業及科研機構所接受。細胞工廠通過增加數量實現細胞的擴增，線性放大的一致性好，有助于縮短工藝開發流程，加快疫苗研發進程。

此外，在疫苗工業化生產中，外源微生物污染也是需要重點關注的一方面。細胞工廠可以通過專業的管路系統實現液體的封閉式轉移，在無菌環境下將培養基或者細胞通過連接管路直接轉移至細胞工廠內，大大降低了疫苗生產過程中外源污染的風險，提高疫苗生產效率。