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隨著食用菌生產技術的發展，液體菌種培養技術逐步在國內外興起，成為食用菌產業化發展的主要方向。在液體菌種的培養中，利用細胞搖瓶進行震蕩培養是常用的方法之一。在培養時，控制好溫度是成功的關鍵。

食用菌菌絲的增殖及次級代謝產物的產生都在各種酶的催化下進行，而酶的催化反應需要適宜的溫度。所以，利用細胞搖瓶進行液體菌種培養時，溫度至關重要。不同菌種對培養溫度的要求也有一定差異，多數食用菌的適溫度在22～30℃范圍內。如香菇為25～26℃，金針菇、平菇為22～25℃，靈芝為28～30℃，云芝為30～31℃，猴頭菇為24～26℃。培養溫度過低，菌絲生長緩慢；培養溫度過高，菌絲球松散、稀疏、活力降低、質量變差。

液體菌種應用于食用菌的生產，對于食用菌行業從傳統生產上的繁瑣復雜、周期長、成本高、憑經驗、拼勞力、手工作坊式向自動化、標準化、規模化升級具有重大意義。目前我國已能進行深層發酵的食用菌有：香菇、平菇、鳳尾菇、美味側耳、鮑魚菇、金針菇、銀耳、黑木耳、猴頭、草菇、蜜環菌、茯苓、滑菇和冬蟲夏草等，其中應用較多的是香菇和平菇。

以上是，細胞搖瓶培養液體菌種時，培養溫度的控制。此外，培養液酸堿度、接入菌種的菌齡、接種量、培養液黏度等因素都是影響菌種生長的重要因素。