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我們立即棄去細胞培養瓶中的培養基，以PBS潤洗2~3次，加入胰酶處理至細胞形態略有改變但未脫離容器時棄去胰酶，加入PBS輕輕潤洗1遍； 

在細胞培養瓶中加入20×雙抗，浸泡細胞3~5min，棄去雙抗，并加入新鮮的完全培養基（含10×雙抗）培養12h；

12h棄去培養基以PBS潤洗2~3遍后加入完全培養基（含10×雙抗），傳代時以較小轉速離心（如平時以1000r/min離心，則可降為800~900r/min離心），仍以含10×雙抗的培養基培養。

若第二代后鏡下找不到細菌，則第三代起可正常培養。正常培養48h后無反彈則可認為污染已清除。

若為霉菌污染，在以PBS潤洗2~3遍后換液，無需加入高濃度雙抗。培養48h后污染未再次出現即可。

若為真菌污染，在PBS潤洗、換液后可加入兩性霉素B（兩性霉素B有細胞毒性，不推薦使用），也可加入300μg/mL氟康唑培養，污染控制后改用150μg/mL培養2~3代。

若懷疑支原體污染，則可進行PCR檢測或直接使用支原體清除試劑（如：某恒生物）。也可購買環丙沙星注射液，于超凈臺內打開直接添加到培養基中，以20μg/mL濃度2代后改用10μg/mL濃度持續培養約2周。